Gradle、ローカルに置いた jar を依存設定するのはいいのだけれども、その jar のソースjarやJavadoc jarを紐付けできないのでちょっと不便。
Gradle というか Eclipse プラグインの Buildship の問題と見るべきかもだけれども…。
ビルドパスの設定から、自前で同じローカルjarファイルを追加して、それにソースやJavadocを紐づければ、やりたいことはできるのだけれども、やや手間なのと、 Gradle の依存関係解決から外れるのでライブラリを入れ替えた場合などにトラブルになりそう。